libcds/src/static_sequence/static_sequence_wvtree.h

   1 /* static_sequence_wvtree.h
   2  * Copyright (C) 2008, Francisco Claude, all rights reserved.
   3  *
   4  * static_sequence_wvtree definition
   5  *
   6  * This library is free software; you can redistribute it and/or
   7  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   8  * License as published by the Free Software Foundation; either
   9  * version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * This library is distributed in the hope that it will be useful,
  12  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14  * Lesser General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  17  * License along with this library; if not, write to the Free Software
  18  * Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
  19  *
  20  */
  21
  22 #ifndef STATIC_SEQUENCE_WVTREE_H
  23 #define STATIC_SEQUENCE_WVTREE_H
  24
  25 #include <iostream>
  26 #include <cassert>
  27 #include <basics.h>
  28 #include <static_bitsequence.h>
  29 #include <static_bitsequence_builder.h>
  30 #include <wt_node_internal.h>
  31 #include <wt_coder_binary.h>
  32 #include <alphabet_mapper.h>
  33 #include <static_sequence.h>
  34
  35 using namespace std;
  36
  37 /** Wavelet tree implementation using pointers.
  38  *
  39  *  @author Francisco Claude
  40  */
  41 class static_sequence_wvtree : public static_sequence {
  42   public:
  43
  44     /** Builds a Wavelet Tree for the string
  45      * pointed by symbols assuming its length
  46      * equals n */
  47     static_sequence_wvtree(uint * symbols, uint n, wt_coder * coder, static_bitsequence_builder * bmb, alphabet_mapper * am);
  48
  49     static_sequence_wvtree(uchar * symbols, uint n, wt_coder * coder, static_bitsequence_builder * bmb, alphabet_mapper * am);
  50
  51     virtual ~static_sequence_wvtree();
  52
  53     virtual uint rank(uint symbol, uint pos);
  54     virtual uint rankLessThan(uint &symbol, uint pos);
  55
  56     virtual uint select(uint symbol, uint i);
  57
  58     virtual uint access(uint pos);
  59     virtual uint access(uint pos, uint &rank)
  60     {
  61         return root->access(pos, rank);
  62     }
  63
  64     virtual uint count(uint s);
  65
  66     virtual uint size();
  67
  68     virtual uint save(FILE * fp);
  69     static static_sequence_wvtree * load(FILE *fp);
  70
  71   protected:
  72
  73     static_sequence_wvtree();
  74
  75     wt_node * root;
  76     wt_coder * c;
  77     alphabet_mapper * am;
  78     //bitmap_builder * bmb;
  79
  80     /** Length of the string. */
  81     uint n;
  82
  83     /** Height of the Wavelet Tree. */
  84     uint max_v;
  85
  86     /** Flag for testing for correcteness. */
  87     bool test;
  88
  89
  90 };
  91 #endif /* _STATIC_SEQUENCE_WVTREE_H */