Initial merge of Diego's cleaned up XMLTree class.
[SXSI/XMLTree.git] / XMLTree.h
index 759aff8..ea9b938 100644 (file)
--- a/XMLTree.h
+++ b/XMLTree.h
  *   along with this program; if not, write to the                            *\r
  *   Free Software Foundation, Inc.,                                          *\r
  *   59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA  02111-1307, USA.                *\r
- ******************************************************************************/ \r
+ ******************************************************************************/\r
 \r
 #ifndef XMLTREE_H_\r
 #define XMLTREE_H_\r
-#include "TextCollection/TextCollection.h"\r
+#include "TextCollection/TextCollectionBuilder.h"\r
 #include <stdio.h>\r
 #include <stdlib.h>\r
 #include <cstring>\r
 \r
-//clash between TextCollection/Tools.h and libcds/includes/basics.h\r
+\r
 #undef W\r
 #undef WW\r
 #undef Wminusone\r
 \r
 #include "bp.h"\r
+//#include "basics.h"\r
 #include <static_bitsequence.h>\r
 #include <alphabet_mapper.h>\r
 #include <static_sequence.h>\r
 using SXSI::TextCollection;\r
+using SXSI::TextCollectionBuilder;\r
 \r
 \r
 // this constant is used to efficiently compute the child operation in the tree\r
@@ -45,11 +47,6 @@ using SXSI::TextCollection;
 \r
 #define PERM_SAMPLE 10\r
 \r
-        // sets bit p in e\r
-#define bitset(e,p) ((e)[(p)/W] |= (1<<((p)%W)))\r
-        // cleans bit p in e\r
-#define bitclean(e,p) ((e)[(p)/W] &= ~(1<<((p)%W)))\r
-\r
 \r
 typedef int treeNode;\r
 typedef int TagType; \r
@@ -60,6 +57,15 @@ typedef struct {
    int max;\r
 } range;\r
 \r
+typedef struct nd {\r
+   uint position;\r
+   struct nd *next;\r
+} ListNode;\r
+\r
+typedef struct {\r
+   ListNode *first;\r
+   ListNode *last;\r
+} TagArrayEntry;\r
 \r
 class XMLTree {\r
    /** Balanced parentheses representation of the tree */\r
@@ -67,42 +73,36 @@ class XMLTree {
  \r
    /** Mapping from tag identifer to tag name */  \r
    unsigned char **TagName;\r
+   uint ntagnames;\r
   \r
    /** boolean flag indicating whether we are indexing empty texts or not */\r
    bool indexing_empty_texts; \r
    \r
    /** Bit vector indicating with a 1 the positions of the non-empty texts. */\r
-   static_bitsequence_rrr02 *EBVector;  \r
+   static_bitsequence *EBVector;  \r
                      \r
    /** Tag sequence represented with a data structure for rank and select */\r
    static_sequence *Tags;\r
+   uint * tags_fix;\r
+   uint tags_blen, tags_len;\r
 \r
    /** The texts in the XML document */\r
    TextCollection *Text;\r
+\r
+   /** The texts in the XML document (cached for faster display) */\r
+   vector<string> CachedText;\r
    \r
-   /** Flag indicating whether the whole data structure has been constructed or \r
-    * not. If the value is true, you cannot add more texts, nodes, etc. */\r
-   bool finished;\r
-\r
-   /** Flag indicating whether the construction of the data structure has been\r
-    * initialized or not (by calling method OpenDocument()). If this is true,\r
-    * you cannot insert new tags or texts. */\r
-   bool initialized;\r
-   \r
-   /* the following components are used for construction purposes */\r
-   pb *par_aux;\r
-   TagType *tags_aux;\r
-   int npar;\r
-   int parArraySize;\r
-   int ntagnames;\r
-   unsigned int *empty_texts_aux;\r
-   bool found_attributes;\r
+   TagArrayEntry *TagArray;\r
+\r
+   // Allows to disable the TextCollection for benchmarkin purposes\r
    bool disable_tc;\r
    \r
 public:\r
+   /** Data structure constructors */\r
+   XMLTree() {;};\r
 \r
-   /** Data structure constructor */\r
-   XMLTree() {finished = false; initialized = false;}; \r
+   XMLTree(pb *par, uint npar, unsigned char **TN, uint ntagnames, uint *empty_texts_bmp, TagType *tags,\r
+           TextCollection *TC, vector<string> CT, bool indexing_empty_t, bool dis_tc);\r
  \r
    /** Data structure destructor */\r
    ~XMLTree();\r
@@ -127,7 +127,10 @@ public:
   \r
    /** IsChild(x,y): returns whether node x is parent of node y. */\r
    bool IsChild(treeNode x, treeNode y);\r
-   \r
+\r
+   /** IsFirstChild(x): returns whether node x is the first child of its parent. */\r
+   bool IsFirstChild(treeNode x);\r
+\r
    /** NumChildren(x): number of children of node x. Constant time with the \r
     * data structure of Sadakane. */\r
    int NumChildren(treeNode x);\r
@@ -165,6 +168,9 @@ public:
     * Very fast in BP. */\r
    treeNode FirstChild(treeNode x);\r
    \r
+   /** LastChild(x): returns the last child of node x.  */\r
+   treeNode LastChild(treeNode x);\r
+   \r
    /** NextSibling(x): returns the next sibling of node x, assuming it \r
     * exists. */\r
    treeNode NextSibling(treeNode x);\r
@@ -173,17 +179,42 @@ public:
     * exists. */\r
    treeNode PrevSibling(treeNode x);\r
    \r
-   /** TaggedChild(x,i,tag): returns the i-th child of node x tagged tag, or \r
+   /** TaggedChild(x,tag): returns the first child of node x tagged tag, or \r
     * NULLT if there is none. Because of the balanced-parentheses representation \r
     * of the tree, this operation is not supported efficiently, just iterating \r
     * among the children of node x until finding the desired child. */\r
-   treeNode TaggedChild(treeNode x, int i, TagType tag);\r
+   treeNode TaggedChild(treeNode x, TagType tag);\r
    \r
+   treeNode SelectChild(treeNode x, TagType *tags, int ntags);\r
+\r
+   /** TaggedSibling(x,tag): returns the first sibling of node x tagged tag, or \r
+    *  NULLT if there is none. */\r
+   treeNode TaggedSibling(treeNode x, TagType tag);\r
+   \r
+   treeNode SelectSibling(treeNode x, TagType *tags, int ntags);\r
+\r
    /** TaggedDesc(x,tag): returns the first node tagged tag with larger \r
     * preorder than x and within the subtree of x. Returns NULT if there \r
     * is none. */\r
    treeNode TaggedDesc(treeNode x, TagType tag);\r
 \r
+   treeNode SelectDesc(treeNode x, TagType *tags, int ntags);\r
+\r
+   treeNode TaggedBelow(treeNode x, TagType *childtags, unsigned int ctlen,\r
+                                TagType *desctags, unsigned int dtlen);\r
+   \r
+   treeNode TaggedNext(treeNode x, TagType *childtags, unsigned int ctlen,\r
+                               TagType *folltags, unsigned int flen,treeNode root);\r
+\r
+   treeNode TaggedDescOnly(treeNode x, TagType *desctags, unsigned int dtlen);\r
+   \r
+   treeNode TaggedDescOrFollOnly(treeNode x, TagType *folltags, unsigned int flen,\r
+                          treeNode root);\r
+\r
+   treeNode TaggedFollOnly(treeNode x, TagType *folltags, unsigned int flen,\r
+                          treeNode root);\r
+   \r
+\r
    /** TaggedPrec(x,tag): returns the first node tagged tag with smaller \r
     * preorder than x and not an ancestor of x. Returns NULLT if there \r
     * is none. */\r
@@ -193,7 +224,18 @@ public:
     * preorder than x and not in the subtree of x. Returns NULLT if there \r
     * is none. */\r
    treeNode TaggedFoll(treeNode x, TagType tag);\r
+\r
+   treeNode TaggedFollBelow(treeNode x, TagType tag,treeNode root);     \r
    \r
+   treeNode SelectFollBelow(treeNode x, TagType *tags, int ntags, treeNode ctx);\r
+\r
+   /** TaggedFollowingSibling(x,tag) */\r
+   treeNode TaggedFollowingSibling(treeNode x, TagType tag);\r
+\r
+   /** TaggedAncestor(x, tag): returns the closest ancestor of x tagged \r
+     * tag. Return NULLT is there is none. */\r
+   treeNode TaggedAncestor(treeNode x, TagType tag);\r
\r
    /** PrevText(x): returns the document identifier of the text to the left of \r
     * node x, or NULLT if x is the root node. */\r
    DocID PrevText(treeNode x);\r
@@ -216,45 +258,8 @@ public:
    \r
    /** ParentNode(d): returns the parent node of document identifier d. */\r
    treeNode ParentNode(DocID d);\r
-\r
-   /** OpenDocument(empty_texts,sample_rate_text,dtc): initilizes the construction\r
-    * of the data structure for the XML document. Parameter empty_texts \r
-    * indicates whether we index empty texts in document or not. Parameter \r
-    * sample_rate_text indicates the sampling rate for the text searching data\r
-    * structures (small values get faster searching but a bigger space \r
-    * requirement). dtc disable the use of the TextCollection\r
-    * (i.e. everything is considered an empty text *)\r
-    * Returns a non-zero value upon success, NULLT in case of \r
-    * error. */\r
-   int OpenDocument(bool empty_texts, int sample_rate_text, bool dtc);\r
-\r
-   /** CloseDocument(): finishes the construction of the data structure for \r
-    * the XML document. Tree and tags are represented in the final form, \r
-    * dynamic data structures are made static, and the flag "finished" is set \r
-    * to true. After that, the data structure can be queried. */\r
-   int CloseDocument();\r
-\r
-   /** NewOpenTag(tagname): indicates the event of finding a new opening tag \r
-    * in the document. Tag name is given. Returns a non-zero value upon \r
-    * success, and returns NULLT in case of error. */\r
-   int NewOpenTag(unsigned char *tagname);\r
-   \r
-   /** NewClosingTag(tagname): indicates the event of finding a new closing tag\r
-    *  in the document. Tag name is given. Returns a non-zero value upon \r
-    *  success, and returns NULLT in case of error. */\r
-   int NewClosingTag(unsigned char *tagname);\r
\r
-   /** NewText(s): indicates the event of finding a new (non-empty) text s in \r
-    * the document. The new text is inserted within the text collection. \r
-    * Returns a non-zero value upon success, NULLT in case of error. */\r
-   int NewText(unsigned char *s);\r
-\r
-   /** NewEmptyText(): indicates the event of finding a new empty text in the \r
-    * document. In case of indexing empty and non-empty texts, we insert the \r
-    * empty texts into the text collection. In case of indexing only non-empty\r
-    * texts, it just indicates an empty text in the bit vector of empty texts. \r
-    * Returns a non-zero value upon success, NULLT in case of error. */\r
-   int NewEmptyText();\r
+   \r
+   treeNode PrevNode(DocID d);\r
 \r
    /** GetTagId(tagname): returns the tag identifier corresponding to a given \r
     * tag name. Returns NULLT in case that the tag name does not exists. */\r
@@ -264,12 +269,23 @@ public:
     * Returns NULL in case that the tag identifier is not valid.*/\r
    unsigned char *GetTagName(TagType tagid);\r
 \r
-\r
+   /** GetTagName(tagid): returns the tag name of a given tag identifier.     \r
+    *  The result is just a reference and should not be freed by the caller.\r
+    */\r
+   const unsigned char *GetTagNameByRef(TagType tagid);\r
+\r
+   /** RegisterTag adds a new tag to the tag collection this is needed\r
+    * if the query contains a tag which is not in the document, we need\r
+    * to give this new tag a fresh id and store it somewhere. A logical\r
+    * choice is here.\r
+    * We might want to use a hashtable instead of an array though.\r
+    */\r
    TagType RegisterTag(unsigned char *tagname);\r
 \r
    bool EmptyText(DocID i) {\r
-      return Text->EmptyText(i);\r
+       return Text->EmptyText(i);\r
    }\r
+\r
    /** Prefix(s): search for texts prefixed by string s. */\r
    TextCollection::document_result Prefix(uchar const *s) {\r
       return Text->Prefix(s);\r
@@ -323,6 +339,11 @@ public:
    bool IsLessThan(uchar const *s) {\r
       return Text->IsLessThan(s);\r
    }\r
+   \r
+   /** Count(s): Global counting  */\r
+   unsigned Count(uchar const *s) {\r
+      return Text->Count(s);\r
+   }\r
 \r
    /** CountPrefix(s): counting version of Prefix(s). */\r
    unsigned CountPrefix(uchar const *s) {\r
@@ -346,23 +367,35 @@ public:
    \r
    /** CountLessThan(s): counting version of LessThan(s). */\r
    unsigned CountLessThan(uchar const *s) {\r
-      return CountLessThan(s);\r
+      return Text->CountLessThan(s);\r
    }\r
    \r
    /** GetText(d): returns the text corresponding to document with\r
     * id d. */\r
    uchar* GetText(DocID d) {\r
-      return Text->GetText(d);\r
+       return Text->GetText(d);\r
+   }\r
+\r
+   uchar* GetCachedText(DocID d) {\r
+     uchar * str = (uchar*) calloc(sizeof(char),(CachedText.at(d).size() + 1));\r
+     strcpy((char*) str,(const char*) CachedText.at(d).c_str());\r
+     return (uchar*) (str);\r
    }\r
    \r
    TextCollection *getTextCollection() {\r
       return Text;\r
    }\r
+   \r
    /** Save: saves XML tree data structure to file. */\r
    void Save(unsigned char *filename);\r
       \r
    /** Load: loads XML tree data structure from file. sample_rate_text \r
     * indicates the sample rate for the text search data structure. */\r
    static XMLTree *Load(unsigned char *filename, int sample_rate_text);   \r
+\r
+   void insertTag(TagType tag, uint position);\r
+   \r
+   void print_stats();\r
 };\r
 #endif\r
+\r