libcds/src/static_sequence/static_sequence_gmr_chunk.h

   1 /* static_sequence_gmr_chunk.h
   2  * Copyright (C) 2008, Francisco Claude, all rights reserved.
   3  *
   4  * gmr_chunk
   5  *
   6  * This library is free software; you can redistribute it and/or
   7  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   8  * License as published by the Free Software Foundation; either
   9  * version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * This library is distributed in the hope that it will be useful,
  12  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14  * Lesser General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  17  * License along with this library; if not, write to the Free Software
  18  * Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
  19  *
  20  */
  21
  22 #ifndef _STATIC_SEQUENCE_GMR_CHUNK_H
  23 #define _STATIC_SEQUENCE_GMR_CHUNK_H
  24
  25 #include <basics.h>
  26 #include <static_sequence.h>
  27 #include <static_bitsequence.h>
  28 #include <static_bitsequence_builder.h>
  29 #include <static_permutation.h>
  30 #include <static_permutation_builder.h>
  31 #include <cassert>
  32 #include <iostream>
  33
  34 using namespace std;
  35
  36 /** Implementation of the Chunk of Golynski et al's rank/select
  37  * data structure [1].
  38  *
  39  * [1] A. Golynski and I. Munro and S. Rao.
  40  * Rank/select operations on large alphabets: a tool for text indexing.
  41  * SODA 06.
  42  *
  43  * @author Francisco Claude
  44  */
  45 class static_sequence_gmr_chunk: public static_sequence {
  46   public:
  47     /** Builds the structures needed for the chunk */
  48     static_sequence_gmr_chunk(uint * sequence, uint chunk_length, static_bitsequence_builder *bmb, static_permutation_builder *pmb);
  49
  50     /** Destroy the chunk */
  51     ~static_sequence_gmr_chunk();
  52
  53     virtual uint access(uint j);
  54     virtual uint select(uint i, uint j);
  55     virtual uint rank(uint i, uint j);
  56     virtual uint size();
  57     virtual uint save(FILE *fp);
  58     static static_sequence_gmr_chunk * load(FILE *fp);
  59
  60   protected:
  61     /** Bitmap */
  62     static_bitsequence * X;
  63     /** Permutation */
  64     static_permutation * permutation;
  65     /** Size of the alphabet */
  66     uint sigma;
  67     /** Length of the chunk */
  68     //uint chunk_length;
  69     static_sequence_gmr_chunk();
  70 };
  71 #endif